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基于全转录组的肿瘤抗原预测方法及其应用【异议或纠错】

档案编号: CQ-054-5433-0878
档案文号:
专利权人: 申请人 
发布时间: 发布时间 
档案分类: 专利权 
分 类 号: 第G16B20/50;G16B25/10;G16B30/10;G16B40/00类
授权状态: 已授权
档案内容: 本发明涉及一种基于全转录组的肿瘤抗原预测方法,包括:根据肿瘤组织和相应癌旁组织的全转录组测序数据,分别进行肿瘤相关抗原的蛋白生成与肽段截取、肿瘤体细胞突变检测以及相应突变肽段截取、肿瘤特异novel转录本的生成与肽段截取、肿瘤组织中基因融合检测及融合肽段截取,获得包括肿瘤相关抗原、肿瘤体细胞突变、肿瘤novel转录本、基因融合的肿瘤特异肽段,计算所获得的肿瘤特异肽段与HLA分子的亲和力以及在各转录本中的表达量,基于肿瘤特异肽段的亲和力值和表达量TPM值,评价候选肿瘤抗原的级别。本发明还提供其应用。采用了本发明的方法及应用,有助于精确计算肿瘤抗原负荷、评估免疫治疗效果、服务后期的肿瘤疫苗设计。
附件下载:  (原始资料备查)

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